TAMRA phosphoramidite,6-isomer

一、产品简介

TAMRA 亚磷酰胺,6-异构体（TAMRA phosphoramidite, 6-isomer），又称四甲基罗丹明亚磷酰胺 6-异构体，是一种橙红色荧光染料活性单体，专用于 DNA/RNA 自动化固相合成的末端荧光标记。其发色团为 TAMRA（四甲基罗丹明，Tetramethylrhodamine），罗丹明母核上的羧基以"6-位"取代方式连接亚磷酰胺官能团，与 5-TAMRA 互为位置异构体。在核酸标记领域，6-异构体是业内公认的标准构型，被广泛应用于 DNA 测序、TaqMan 探针、分子信标及荧光原位杂交（FISH）等高分辨率场景。

二、产品别名

中文别名：四甲基罗丹明亚磷酰胺 6-异构体、6-TAMRA 亚磷酰胺、6-羧基四甲基罗丹明亚磷酰胺
英文别名：6-TAMRA phosphoramidite、6-Carboxytetramethylrhodamine phosphoramidite

三、基础信息

（部分数据为公开来源收录，仅供参考）

四、光谱与化学性质

本产品为红色荧光单体，在寡核苷酸上激发/发射波长约为 Ex/Em 541/567 nm，属罗丹明类红色荧光通道，亮度高、光稳定性好。与 5-异构体相比，6-TAMRA 的反相 HPLC 保留行为更规整，单一异构体产物峰形尖锐、分辨率高，避免了 5(6) 混合异构体在纯化中出现的峰展宽与谱带拖尾，因此特别适合对纯度与重现性要求严苛的核酸研究。将 TAMRA 连接于寡核苷酸后，其荧光发射强度相较游离染料可提升数倍，信号表现优于部分猝灭型染料。

五、主要用途

• 寡核苷酸 5' 端标记：在固相亚磷酰胺法合成 DNA/RNA 探针时，于序列末端定点引入荧光基团，一步制备荧光标记引物、分子信标与 TaqMan 探针。
• 实时荧光定量 PCR（qPCR）：作为 FRET 受体与 FAM 等供体搭配，用于探针法核酸检测，光谱分离度高、背景低、灵敏度好。
• 荧光原位杂交（FISH）与基因探针：制备高纯度荧光核酸探针，用于染色体定位、病原体检测与基因表达分析。
• DNA 测序与多重检测：6-异构体的单一峰特性使其成为高通量测序与多重荧光分型的可靠标记原料。

六、合成使用与脱保护

该类亚磷酰胺单体通过标准亚磷酰胺三酯法接入寡核苷酸链，所有合成操作须严格在无水、无氧条件下进行，以保护亚磷酰胺基团的反应活性。需特别注意的是，TAMRA 染料的脱保护须遵循供应商推荐方案——直接使用常规浓氨水处理会导致荧光基团不可逆降解、标记失败。合成产物与原料均应避光、于 -20℃ 以下干燥保存，避免反复冻融与强光照射，以防荧光淬灭。

七、储存与操作

产品为固体粉末，建议 -20℃ 避光干燥保存；使用前于干燥环境中取出，溶解于乙腈等无水溶剂。操作时佩戴防护手套，避免与皮肤直接接触及吸入粉尘。本说明基于公开资料整理，具体应用请以实际实验体系与供应商技术资料为准。